Dr. Martin Gencik, FA für Medizinische Genetik
Brünnlbadgasse 15, 1090 Wien
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GUTACHTEN VAGINALES MIKROBIOM
Indikation
Vaginales Bakterienprofil zur Differenzierung Eubiose/Dysbiose
Diagnose
Der gefundene Community State Typus CST IVC1 mit einer Dominanz von Streptokokken (ca. 50%), dem Nachweis weiterer potentiell pathogener Arten (Sneathia vaginalis ca. 5%) und der Reduktion von Laktobazillen (L. jensenii ca. 3%, L. crispatus ca. 1%) indiziert ein dysbiotisches vaginales Mikrobiom (1,2,3,4). Dieses Ungleichgewicht drückt sich auch aus in der signifikant erhöhten bakteriellen Artenzahl (Artenreichtum = 52).
Ergebnisse
Fundamentale Mikrobiom Parameter
Messwerte des Bakterienspektrums.

Mikrobiom Diversität (Shannon): hoch
Resilienz = 9.16
Die Artenvielfalt liegt im Bereich der oberen 25% der untersuchten Proben.
Shannon-Diversität im Vergleich zur Referenzpopulation (weiße Linie = 50. Perzentile). Der schwarze Balken/Pfeil zeigt den Wert für diese Probe an. 75 % der gesunden Proben fallen in den grünen Bereich. Eine Minderheit der Referenzproben hat Werte im gelben/roten Bereich. Die Shannon-Alpha-Diversität ist ein statistischer, quantitativer Wert, der die Anzahl der nachgewiesenen bakteriellen Sequenzen (Reichhaltigkeit) und die Gleichmäßigkeit ihrer Verteilung kombiniert..
Mikrobiom Artenreichtum: hoch
Artenanzahl = 52.0
Der Artenreichtum liegt im Bereich der oberen 25% der untersuchten Proben.
Anzahl der Arten im Vergleich zur Referenzpopulation (weiße Linie = 50. Perzentile). Der schwarze Balken/Pfeil zeigt den Wert für diese Probe an. 75 % der gesunden Proben fallen in den grünen Bereich. Eine Minderheit der Referenzproben hat Werte im gelben/roten Bereich. Ein hoher Gehalt an Lactobacillus und eine geringe Gesamtdichte zeigen ein gesundes Mikrobiom an. Messungen einzelner Proben werden mit der allgemeinen Bevölkerung verglichen.
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Mikrobiom Artengleichheit: hoch
Artengleichheit = 0.6
Die Artengleichheit liegt im oberen 25% Bereich der untersuchten Proben.
Gleichmäßigkeit der Arten im Vergleich zur Population (weiße Linie = 50. Perzentile). Der schwarze Balken/Pfeil zeigt den Wert für diese Stichprobe. 75 % der Population fallen in den grünen Bereich. Eine Minderheit der Proben hat Werte im gelben/roten Bereich. Die Werte der Gleichmäßigkeit einer gesunden Vaginalflora sind aufgrund eines hohen Anteils an Lactobacillen niedrig. Die Messungen der einzelnen Proben werden mit denen der Allgemeinbevölkerung verglichen.

Bakterienstämme Assoziiert mit Infektionen

Es gibt nur wenige Bakteriengruppen, die mit gesunden Menschen in Verbindung gebracht werden, darunter die Phyla Firmicutes und Bacteriodetes. Unter den richtigen Umständen ist fast jedes Bakterium potentiell pathogen. Insbesondere sind die Stämme der Fusobakterien und der Proteobakterien mit opportunistischen Infektionen assoziiert.
Prozentanteil Fusobacteria im Mikrobiom: potentiell pathogen
Fusobacterien = 4.711
Der Anteil der Fusobakteria ist höher als 90% der Vergleichsproben.
Prozentualer Anteil der Fusobakterien im Vergleich zur Referenzpopulation. Der schwarze Balken/Pfeil zeigt den Wert für diese Probe an. Gesündere Proben weisen im Allgemeinen niedrigere Fusobakterienwerte auf. Werte im gelben/roten Bereich sind höher als 75 % oder mehr der Population.. Der Stamm der Fusobakterien enthält mehrere bekannte menschliche Krankheitserreger. Bestimmte Fusobakterien können Entzündungen fördern und zu Infektionen und Krankheiten beitragen. Die einzelnen Messbereiche basieren auf der Referenzpopulation.
Fusobacteria Arten Detektiert
Der Stamm der Fusobakterien enthält mehrere bekannte menschliche Krankheitserreger. Bestimmte Fusobakterien können Entzündungen fördern und zu Infektionen und Krankheiten beitragen. Die einzelnen Bereiche basieren auf der Referenzpopulation.
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Bakterienstämme assoziiert mit Erkrankungen
Prozentanteil Proteobakteria am Mikrobiom: potentiell pathogen
Proteobakteria = 0.827
Der Anteil der Proteobakteria ist höher als 90% der getesteten Proben.
Prozentsatz der Proteobakterien im Vergleich zur Referenzpopulation (weiße Linie = 50. Perzentile). Der schwarze Balken/Pfeil zeigt den Wert für diese Probe an. 75 % der Population fallen in den grünen Bereich. Eine Minderheit der Referenzproben hat Werte im gelben/roten Bereich. Der Stamm der Proteobakterien enthält mehrere bekannte menschliche Krankheitserreger. Ein hoher Gehalt an Proteobakterien kann Entzündungen fördern und zu Infektionen und Krankheiten beitragen.
Proteobakteria Arten Detektiert
Der Stamm der Proteobakterien enthält mehrere bekannte menschliche Krankheitserreger. Ein hoher Gehalt an Proteobakterien kann Entzündungen fördern und zu Infektionen und Krankheiten beitragen.
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Species Barplot
Die Farbbalken repräsentieren die relativen Anteile der Bakterienarten am Mikrobiom.
Balkendiagramm Arten

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Am Häufigsten Detektierte Bakterienarten
Streptococcus mitis: 32.88%
Seltenes Bakterium
Die Bedeutung von Streptococcus mitis ist nicht genau definiert. Er gilt nicht als häufiger Krankheitserreger.
Gemella haemolysans: 24.41%
Seltenes Bakterium
Die Bedeutung von Gemella haemolysans ist nicht genau definiert. Er gilt nicht als häufiger Krankheitserreger.
Streptococcus agalactiae: 8.62%
Potentiell Pathogen
Obwohl es häufiger mit Infektionen bei Neugeborenen in Verbindung gebracht wird, kann es auch bei Erwachsenen zu Harnwegsinfektionen führen, insbesondere bei schwangeren Frauen.
Streptococcus salivarius: 7.25%
Seltenes Bakterium
Die Bedeutung von Streptococcus salivarius ist nicht genau definiert. Er wird nicht als häufiger Krankheitserreger angesehen.
Sneathia vaginalis: 4.71%
Potentiell Pathogen
Niedrige Werte von Sneathia sind üblich, aber höhere Werte dieser toxinproduzierenden, gramnegativen Spezies wurden mit Schwangerschaftskomplikationen und gelegentlichen Infektionen in Verbindung gebracht.
Staphylococcus hominis: 3.77%
Seltenes Bakterium
Die Bedeutung von Staphylococcus hominis ist nicht genau definiert. Er wird nicht als häufiger Krankheitserreger angesehen.

'Prozentualer Anteil der häufigsten Arten in der Probe im Vergleich zur Referenzpopulation (weiße Linie = 50. Perzentile). Der schwarze Balken/Pfeil zeigt den Wert für diese Probe an. 75 % der Population fallen in den grünen Bereich. Eine Minderheit der Referenzproben hat Werte im gelben/roten Bereich. Beachten Sie, dass bei potenziellen Krankheitserregern Werte, die höher als die Mehrheit der Population im roten Bereich liegen, auf eine Überrepräsentation des Erregers hindeuten, während Werte, die niedriger als die Mehrheit der Population sind, auf eine Unterrepräsentation des Erregers hindeuten.'
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Spezies Referenz Diagramm - Gesamtmikrobiom
Sunburst Diagramm - Die Farbscheiben stellen die relative Darstellung der bakteriellen Taxa dar. Der mittlere Ring ist die niedrigste Auflösung (Bereich/Königreich), gefolgt von Stamm, Klasse, Ordnung, Familie, Gattung, Art, der letzte äußere Ring ist die individuelle Amplikonsequenzvariante (ASV) der DNA-Sequenzen für die Arten. Beachten Sie, dass Stämme in der Regel mehrere ASVs haben. Die letzte Zahl im ASV-Ring ist die prozentuale Identität (PID) mit der genannten Art. Neuartige Stämme haben in der Regel eine niedrigere PID als bekannte Stämme. Eng verwandte Stämme haben eine PID von mehr als 98 %.
Arten Sunburst Diagramm

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Hauptkomponentenanalyse (PCA) der Probe, die zusammen mit anderen Proben aus der Referenzdatenbank geplottet wurde. Die Farben der Punkte beziehen sich auf die Shannon Diversity Microbiome Resilience. Hellere Farben haben höhere Werte für die Mikrobiom-Resilienz, dunklere Farben haben eine geringere Diversität und Gleichmäßigkeit und dementsprechend eine geringere Resilienz. Die Proben mit der höchsten Diversität gruppieren sich tendenziell in der Mitte des Diagramms.
PCA Referenz Population Raumdiagramm

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Arten Tabelle- Gesamt Mikrobiom
Liste aller Arten in der Abstrich und ihr relativer Anteil
Species Table
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Zusammenfassung und Allgemeine Beurteilung

Interpretation
Die Analyse der vaginalen Mikrobiomzusammensetzung mit den vorliegenden Bakterien weist auf eine nicht-laktobazillendominierte Flora hin (CST IVC1), die mit verschiedenen gesundheitlichen Implikationen in Verbindung gebracht werden kann. Eine solches Bakterienspektrum ist ein Hinweis auf ein gestörtes mikrobielles Gleichgewicht (Dysbiose).

1.Streptococcus mitis (32.88%): Normalerweise ein Kommensale des oralen Mikrobioms, wird Streptococcus mitis gelegentlich in vaginalen Proben gefunden. Es ist im Allgemeinen nicht pathogen, kann jedoch bei immungeschwächten Personen Infektionen verursachen. In der Vagina kann eine Überrepräsentation auf eine abweichende Flora hinweisen, die möglicherweise mit Entzündungen oder Infektionen assoziiert ist.

2.Gemella haemolysans (24.41%): Gemella haemolysans ist ebenfalls ein häufiger Bewohner des oberen Atmungstrakts und wird seltener in der Vagina nachgewiesen. Hohe Anteile dieses Bakteriums könnten mit einer Dysbiose assoziiert sein, was auf eine vaginale Umgebung hinweist, die nicht von schützenden Laktobazillen dominiert wird.

3.Streptococcus agalactiae (8.62%): Diese Spezies, auch als Gruppe-B-Streptokokken bekannt, ist potenziell pathogen und kann bei Schwangeren zu neonatalen Infektionen führen. In der Vagina kann ein Anstieg von S. agalactiae das Risiko für Infektionen und Komplikationen, insbesondere während der Schwangerschaft, erhöhen.

4.Streptococcus salivarius (7.25%): Streptococcus salivarius gehört ebenfalls zur normalen oralen Flora. Seine Präsenz in der Vagina könnte auf eine Kontamination oder Dysbiose hinweisen, da es in der gesunden vaginalen Flora nicht häufig vorkommt.

5.Sneathia vaginalis (4.71%): Diese Bakterienart wird häufig bei bakterieller Vaginose nachgewiesen und ist ein Hinweis auf eine Störung des mikrobiellen Gleichgewichts. Ihre Assoziation mit Entzündungen und vaginellen Infektionen macht sie zu einem potenziellen Indikator für vaginale Dysbiose.

6.Staphylococcus hominis (3.77%): Diese Hautbakterien sind nicht typischerweise in hohen Anteilen in der Vagina präsent. Ihre erhöhte Prävalenz kann auf eine gestörte Flora hindeuten, die möglicherweise durch äußere Faktoren, wie Hygieneprodukte oder mechanische Reizungen, beeinflusst wurde.

Insgesamt zeigt diese Mikrobiomzusammensetzung eine erhebliche Abweichung von der schützenden, laktobazillendominierten vaginalen Flora, die mit einem höheren Risiko für Infektionen und Entzündungen einhergehen könnte. Eine nähere klinische Bewertung könnte ratsam sein, insbesondere in Bezug auf die potenzielle Rolle von Sneathia vaginalis und Streptococcus agalactiae. Es wäre ebenfalls sinnvoll, Maßnahmen zur Förderung einer gesunden vaginalen Mikrobiota in Betracht zu ziehen, einschließlich der Verwendung von Probiotika oder anderen therapeutischen Ansätzen (5-22).
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Personalisierte Unterstützende Therapien
Basierend auf der analysierten Zusammensetzung des vaginalen Mikrobioms und den identifizierten Bakterien, könnten gezielte probiotische Therapien dazu beitragen, das mikrobielle Gleichgewicht wiederherzustellen und das Wachstum pathogener oder dysbiotischer Bakterien zu hemmen. Im Folgenden werden spezifische probiotische Ansätze vorgeschlagen, die auf die identifizierten Bakterien abgestimmt sind:

1.Förderung von Laktobazillen zur Hemmung von Streptokokken und Gemella spp. Da Lactobacillus-Arten in einer gesunden vaginalen Mikrobiota dominieren sollten, können probiotische Präparate, die Lactobacillus crispatus oder Lactobacillus gasseri enthalten, helfen, das mikrobielle Gleichgewicht wiederherzustellen. Studien zeigen, dass diese Laktobazillenarten das vaginale Milieu ansäuern und dadurch das Wachstum von Streptokokken wie Streptococcus mitis und Streptococcus agalactiae sowie von Gemella haemolysans hemmen können. Eine regelmäßige Anwendung von Probiotika, z.B. in Form von Vaginalzäpfchen oder oralen Präparaten, könnte dazu beitragen, eine Laktobazillendominanz wiederherzustellen und pathogene Bakterien zu unterdrücken.(Mei and Li 2022)

2.Sneathia vaginalis ist häufig mit bakterieller Vaginose (BV) assoziiert. Die Therapie sollte darauf abzielen, die Bedingungen, die das Wachstum von Sneathia begünstigen, zu eliminieren. Probiotika, die Lactobacillus reuteri und Lactobacillus rhamnosus enthalten, haben sich als wirksam bei der Behandlung von BV erwiesen, indem sie das mikrobielle Gleichgewicht fördern und pathogene Organismen verdrängen.
Eine orale Einnahme von Produkten wie Lactobacillus reuteri RC-14 und Lactobacillus rhamnosus GR-1 kann zur Wiederherstellung einer gesunden vaginalen Mikrobiota beitragen und BV-Symptome lindern. Mehrere klinische Studien haben gezeigt, dass diese Stämme das Wiederauftreten von BV reduzieren und die vaginale Gesundheit langfristig stabilisieren können (Reid et al., 2018).

3.Da Staphylococcus hominis typischerweise ein Hautbakterium ist, könnte die erhöhte Präsenz in der Vagina auf eine äußere Kontamination oder eine Schwächung der vaginalen Barrierefunktion hinweisen. Um das Wachstum von S. hominis zu verringern, könnten Probiotika, die auf die Förderung der natürlichen vaginalen Mikroflora abzielen, wie Lactobacillus crispatus, nützlich sein.
Untersuchungen haben gezeigt, dass Lactobacillus crispatus in der Lage ist, sowohl das Immunsystem der Vaginalschleimhaut zu stärken als auch das Wachstum unerwünschter Mikroorganismen zu hemmen (Ravel et al., 2011).

4.Allgemeiner Ansatz zur Unterstützung der vaginalen Gesundheit

Zusätzlich zu den spezifischen Probiotika kann die allgemeine Verwendung von Multi-Laktobazillen-Präparaten empfohlen werden, um die vaginale Mikrobiota zu stabilisieren. Präparate, die Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus plantarum und Bifidobacterium bifidum enthalten, könnten hilfreich sein, da sie nachweislich die vaginale Gesundheit verbessern, das Immunsystem unterstützen und die Bildung eines gesunden Biofilms fördern.
Zusammenfassung der empfohlenen Probiotika:
• Lactobacillus crispatus und Lactobacillus gasseri zur Hemmung von Streptokokken und Gemella spp.
• Lactobacillus reuteri und Lactobacillus rhamnosus zur Bekämpfung von Sneathia vaginalis.
• Lactobacillus crispatus zur Reduzierung von Staphylococcus hominis.
• Multi-Laktobazillen-Präparate zur allgemeinen Förderung der vaginalen Gesundheit.

Durch den gezielten Einsatz dieser Probiotika könnten die Chancen auf eine Wiederherstellung der gesunden vaginalen Mikroflora und eine Verringerung des Risikos von Infektionen und Dysbiosen signifikant verbessert werden.
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Material
OMNIgene•VAGINAL OMR130
Localization: Vagina
Description: Microbiom Abstrichprobe

Methoden

Die Abstrichprobe wurde für den Transport ins Labor mit dem OMNIgene VAGINAL OMR130 Abnahmeset stabilisiert. Die DNA-Isolierung erfolgte mit ZymoBIOMICS DNA Miniprep, Kat: D4300. DNA-Barcoding und Bibliotheksvorbereitung wurden mit dem Intus Biosciences StrainID Kit (Intus Biosciences) und dem LSK-114 Kit (Oxford Nanopore) durchgeführt. Die 2,5 kb Basenpaar-PCR-Produkte wurden mit einem MinION MK1C auf einer Fließzelle 10.4.1 (Oxford Nanopore) sequenziert und mit der Titan Bioinformatics Pipeline (Intus Biosciences) analysiert.

Literatur

Unterteilung des vaginalen Mikrobioms

(for details see: Rosca, A. S., Castro, J., Sousa, L. G., & Cerca, N. (2020). Gardnerella and vaginal health: the truth is out there. FEMS microbiology reviews, 44(1), 73-105.)
Bakterien spielen eine wesentliche Rolle für die Gesundheit der Vagina. Wissenschaftler haben herausgefunden, dass gesunde Menschen verschiedene Gruppen von Bakterien haben können, die als Community State Types bezeichnet werden, und dass die Prävalenz von CST-Gruppen zwischen verschiedenen ethnischen Gruppen, Kulturen und Verhaltensweisen variieren kann.

Lactobacillus-Gruppen (CST I, II, III und V):
Laktobazillen sind die häufigsten und wichtigsten Bakterien in der vaginalen Gemeinschaft, typische Arten sind L. crispatus, L. gasseri, L. iners und L. jensenii. Sie tragen zur Aufrechterhaltung eines ausgeglichenen Milieus bei, indem sie Milchsäure produzieren, die den vaginalen pH-Wert unter 4,5 hält, und Bakteriozine, die die Arten von Bakterien einschränken, die sich in der Umgebung ansiedeln können.

CST IV Gruppe:
Etwa 30 % der Frauen haben keine nennenswerten Mengen an Lactobacillus; stattdessen enthält das vaginale Milieu eine Mischung aus anderen Bakterien. Einige dieser Bakterien können unter einer Vielzahl unterschiedlicher Bedingungen überleben. Dazu gehören Gardnerella, Atopobium, Prevotella, Mobiluncus, Sneathia, Eggerthella, Finegoldia, Megasphaera, Peptoniphilus, Corynebacterium, Streptococcus und Aerococcus.

Grundlegende Literatur
Zur Erstellung des Berichts und der Schlussfolgerungen verwendete Literatur.

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Quellen Personalisierte Unterstützende Therapien: Mei and Li 2022, The role of probiotics in vaginal health. Front Cell Infect Microbiol12, 963868; https://doi.org/10.3389/fcimb.2022.963868 Liu et al 2023, Use of probiotic lactobacilli in the treatment of vaginal infections: In vitro and in vivo investigations, Front Cell Infect Microbiol 13, 1153894; https://doi.org/10.3389/fcimb.2023.1153894
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Hinweis: Wir möchten darauf hinweisen, dass die Ergebnisse molekulargenetischer Tests immer im klinischen Kontext betrachtet und interpretiert werden sollten.

Dr. med. Martin Gencik Dr. phil. Alfred Schöller Vivien Horvath MSc

Facharzt für Medizinische Genetik Biologe Ernährungswissenschaftlerin