Mikrobiom - FAQ Befund

MedGene® - Mikrobiom

Bewertung der assoziierten Erkrankungen im Balkendiagramm

Zuerst wird jedes Taxon der Probe in jeder Tabelle mit dem Referenzkollektiv verglichen. Daraus resultiert die folgende Information: wie viele Arten sind in jeder Tabelle und in welchem Referenzbereich liegt die relative Anzahl der gemessenen DNA Sequenzen (oberhalb, innerhalb oder unterhalb 75% des Referenzkollektivs). Die Tabellenresultate werden mit dem lokalen Referenzkollektiv von Stuhlproben abgeglichen (beispielsweise haben 75% der Probanden durchschnittlich ein bis vier Bakterienarten auf einer Assoziationstabelle und eine Art liegt über oder unter 75% der Normalbevölkerung). Ausreißer, die im Bereich 25% darüber oder darunter liegen, werden markiert. Jedem Erkrankungsrisiko sind mehrere Assoziationstabellen zugeordnet, wobei wieder die 75% Regel angewendet wird. Dann errechnet der Algorithmus auf Grund der genannten Regeln die Farben in den Balkendiagrammen (grün = Normalbereich, gelb = verbesserbar, rot = langfristig ist ein entsprechendes Risiko vorhanden).

Klassifizierungen funktionelle Gruppen und mögliche Marker für Erkrankungen

MedGene Mikrobiom Faq Befund

Die Balkenfarben differenzieren Ihre persönlichen funktionellen Mikrobiomgruppen in drei Bereiche: grün= 75% des Normkollektivs (gesundheitsfördernd bis hervorragend), gelb= 25% des Normkollektivs (verbesserbar), rot= <5% des Normkollektivs bzw. pathogene Art/en detektiert (langfristig möglicherweise gesundheitsschädigend). Die Bakterienarten werden gruppiert in funktionelle Gruppen und in solche, die aus der medizinischen Literatur mit verschiedenen Erkrankungen assoziiert sein können. In diesem Zusammenhang können Bakterienarten, bezogen auf das Referenzkollektiv, erhöht oder vermindert vorkommen. Sind beide spezifischen Tabellen im verbesserbaren bzw. gesundheitsschädigendem Bereich, dann erscheint die Ampelfarbe gelb bzw. rot.

Berechnung der Scores für die Tabellen

Die Scores der Gruppen werden wie folgt berechnet: der Gesamtscore der Gruppe setzt sich zusammen aus der Anzahl der detektierten Bakterien plus 0,5 mal der Anzahl der als „hoch“ plus 1 x der Anzahl der als „sehr hoch“ eingestuften Bakterien*. Beispiel: 10 Arten plus 0,5 x hoch plus 1 x sehr hoch = Messwert 11,5.

MedGene Mikrobiom Faq Befund

Die Tabellen listen die gefundenen Bakterienarten Ihrer Stuhlprobe bezüglich ihrer Relevanz für die Gesundheit auf. Die nachgewiesenen Arten werden mit einer Literaturdatenbank abgeglichen, um sie auf bereits beschriebene gesundheitsfördernde bzw. gesundheitsschädliche Eigenschaften zu überprüfen. Einige bestimmte Spezies sind mit Risiken für Erkrankungen (Syndrome) assoziiert, wenn ihre relative Anzahl im direkten Vergleich zu einem lokalen Normkollektiv erhöht oder erniedrigt ist. Auf die erste Spalte (Bakterienart) mit dem Gattungs- und Artnamen des Bakteriums folgt der gemessene Wert (Messwert). Dieser wird errechnet aus dem prozentualen Anteil der dieser Art zugeordneten Anzahl der DNA-Sequenzen zu der Gesamtzahl aller in der Probe detektierten DNA-Sequenzen (fachsprachlich DNA reads). Die dritte Spalte (Normkollektivwert) gibt den Referenzbereich bezogen auf das Normkollektiv (lokale Stuhlproben von gesunden Personen) an. Dazu werden alle Daten gezehntelt und der neun Zehntelbereich (90%) als Referenzbereich definiert. In der darauf folgenden Reihe (außerhalb des Normbereichs) werden Werte außerhalb der Norm begrifflich festgelegt:

Sehr hoch - Messwert ist >10-Fach des Durchschnittswerts des Normkollektivs und >0,3% am relativen Anteil der Gesamtzahl aller DNA-Sequenzen des Mikrobioms.

Hoch - Messwert ist im Bereich >90% des Normkollektivs; oberste Dezile.

Niedrig - Messwert liegt im Bereich < 90 % des Normkollektivs; unterstes Dezil.

Selten - Messwert ist >2-Fach der Standardabweichung des Durchschnittswerts des Normkollektivs und <0,3% am relativen Anteil der Gesamtzahl aller DNA-Sequenzen des Mikrobioms.

MedGene Mikrobiom Faq Befund